A Igreja da Misericórdia começou a ser construída em 1593 e foi, em 1647, alvo de grandes obras de remodelação.

Foi neste momento que o altar-mor foi introduzido, um dos ex-líbris da Igreja da Misericórdia de Vouzela, que representa Nossa Senhora e São José. Depois de um longo período de encerramento, foi reaberta ao culto em 1960, tendo sofrido novamente obras de remodelação, onde a talha dourada foi destacada, assim como o retábulo. O seu exterior não passa despercebido pelos bonitos azulejos azuis e brancos que a cobrem, em pleno centro histórico de Vouzela.